Tras cuatro meses de su secuestro, cometido por el Ejército de Liberación Nacional, ELN. Bayter regresó al seno de su hogar y, desde la parte alta de su vivienda, saludó a la ciudadanía que fue a recibirlo tras enterarse de su regreso a casa.
Aunque se desconoce con exactitud su estado de salud, el odontólogo se le vio en buen estado.
Vale recordar que el rapto de Juan Carlos Bayter se dio iba a llevar a sus hijos al colegio. En ese trayecto, fue interceptado por varios hombres armados, quienes lo llevaron hacia el departamento de Cesar. Poco después, lo bajaron de su camioneta, la incendiaron y lo subieron a otro vehículo.
La comunidad banqueña y magdalenense se movilizó y manifestó de varias formas pidiendo su liberación. Hasta hoy se supo de su paradero.